昆明动物所等在基因组稳定性驱动的低氧适应研究中取得进展

　　近期，中国科学院昆明动物研究所研究员赵博课题组在Journal of Experimental & Clinical Cancer Research 上发表了题为RETSAT associates with DDX39B to promote fork restarting and resistance to gemcitabine based chemotherapy in pancreatic ductal adenocarcinoma 的研究论文，报道了RETSAT 基因在基因组稳定性维持和低氧耐受中的功能和机制。

　　基因组稳定性的维持以氧作为必要条件。特别是在极端低氧（氧浓度低于1%）条件下，HIF信号通路显著下调DNA损伤反应（DNA Damage Response; DDR）核心组分的表达，引起DNA复制和修复效率降低，造成DNA损伤累积和基因组不稳定，细胞被动地进入凋亡或衰老。然而，一些特例值得关注。例如，高原动物细胞能够较强地维持基因组稳定并耐受低氧，提示可能存在某种未知通路或机制，赋予细胞主动增强基因组稳定性的能力来适应低氧。另外，这些机制能否为极端低氧的实体瘤（如胰腺癌）防治提供新视角和新思路，值得探索。

　　　RETSAT 是一个在青藏高原哺乳动物类群中趋同演化和显著正选择基因（昆明动物所研究员施鹏团队成果），但其编码蛋白在基因组稳定性调控中是否发挥功能，尚不清楚。该研究在基础方面，利用iPOND (isolate proteins on nascent DNA)、DNA fiber assay、Comet assay等基因组稳定性研究经典技术，确定了RETSAT是一个新的复制叉结合蛋白。在低氧条件下，RETSAT招募RNA解旋酶DDX39B入核，有效清除R-Loop，避免转录-复制冲突 (Transcription–replication collisions)，保障DNA复制有序进行，促进细胞的低氧适应。在应用方面，利用TCGA数据库、临床病理样本、3D培养模型、胰腺癌类器官模型和小鼠移植瘤模型等，确定了RETSAT 高表达与胰腺癌预后和吉西他滨化疗获益均呈现负相关，发现了DDX39B抑制剂CCT018159在联合药物治疗胰腺癌中的价值。

　　昆明动物所特别研究助理涂秋、博士研究生刘秀云、昆明动物所与苏州大学联合培养博士研究生姚晓晴、昆明医科大学博士研究生李瑞雪、昆明动物所项目聘用人员刘高京为该论文的共同第一作者。赵博、施鹏、昆明医科大学附属第二医院教授朱洪、苏州大学教授许国强为该论文的共同通讯作者。该研究得到了中国科学院人才项目等的支持。

　　文章链接：https://jeccr.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13046-022-02490-3

　　RETSAT和DDX39B相互作用促进细胞R-loop清除、复制叉重启和DNA复制压力耐受