昆明动物所揭示蜂猴适应性进化的遗传机制和群体历史

　  中国科学院昆明动物研究所研究员吴东东团队最新研究成果以Functional genomics analysis reveals the evolutionary adaptation and demographic history of pygmy lorises为题，于近日发表在PNAS上。该研究揭示了蜂猴适应性进化的遗传机制和群体历史，被选为当期的封面文章。

　　蜂猴是一类濒危的灵长类动物，在进化过程中表现出许多不寻常的生理和行为特征，包括低代谢率、行动缓慢和夜行性等。蜂猴为杂食动物，主要以野果为食，也能以有毒昆虫和树胶为食物。为探究蜂猴适应性进化的遗传机制，吴东东团队从头组装了倭蜂猴（Xanthonycticebus pygmaeus）染色体水平的基因组序列，并对50只倭蜂猴和6只孟加拉蜂猴(Nycticebus bengalensis)进行全基因组重测序。研究发现，与解毒有关的GSTA基因家族在蜂猴中特异性扩张，其在蜂猴肝脏中表现出特异性高表达。此外，研究人员发现PITRM1基因在蜂猴和考拉之间表现出趋同进化。功能实验证明蜂猴PITRM1酶活性显著降低，这可能导致了倭蜂猴低代谢率的特征。研究人员还在倭蜂猴中鉴定到与肌肉发育有关的正选择基因MYOF，可能与其行动缓慢相关。相比较其它物种，倭蜂猴中正选择基因PER2与昼夜节律核心蛋白CRY的结合能力更弱，这一发现可能与该物种不寻常的昼夜节律有关。最后，群体基因组学分析显示，生活在同一地区的倭蜂猴和孟加拉蜂猴在过去100万年的时间里，在有效群体大小动态变化上表现出了一种逆相关关系，这意味着两个物种分化后存在物种间的竞争关系。 

　　吴东东为该论文的通讯作者。昆明动物所助理研究员李明莉，昆明动物所博士后王胜，上海交通大学医学院副研究员许鹏辉，昆明动物所助理研究员田航宇为该论文的共同第一作者。该项目得到了中国科学院战略先导项目、国家自然科学基金项目、云南省基础研究专项、中国科学院野生物种种质库动物分库的支持。 

    论文链接：https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2123030119